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6种重要经济鱼类生长激素完整cDNA的克隆和序列分析(英文)

文献类型: 中文期刊

作者: 张竞男 1 ; 宋平 1 ; 胡珈瑞 2 ; 莫赛军 1 ; 彭茂宇 1 ; 周伟 1 ; 邹记兴 3 ; 胡隐昌 4 ;

作者机构: 1.武汉大学生命科学学院教育部发育生物学重点实验室

2.武汉大学中南医院

3.中国科学院南海海洋研究所

4.中国水产科学研究院珠江水产研究所

关键词: 生长激素;完整cDNA;序列分析

期刊名称: 遗传学报

ISSN: 0379-4172

年卷期: 2005 年 32 卷 01 期

页码: 19-29

收录情况: SCI ; 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过RT PCR、3′ RACE、5′ RACE方法 ,从 6种重要经济鱼类———大眼鳜 (Sinipercakneri)、石斑鱼 (Epinepheluscoioides)、黄鳝 (Monopterusalbus)、鲶鱼 (Silurusasotus)、泥鳅 (Misgurnusanguillicaudatus)和方正银鲫 (CarassiusauratusgibelioBloch ,FangZhengcruciancarp)中克隆了生长激素 (GrowthHormone ,GH)的完整cDNA序列 (除石斑鱼序列外 ,其他生长激素序列均系第一次克隆 ) ,并详细分析了其序列特征。测序结果显示 ,克隆的 6种GHcDNA长度依次为95 3bp、10 2 3bp、82 5bp、10 82bp、115 4bp和 1180bp ,它们均包含一个长度为 6 0 0个左右核苷酸的完整阅读框 ,分别编码一个 2 0 0个左右氨基酸的蛋白 :大眼鳜、石斑鱼和黄鳝GH为 2 0 4个氨基酸 ,鲶鱼GH为 2 0 0个氨基酸 ,泥鳅和方正银鲫GH为 2 10个氨基酸。这 6种蛋白序列与其他已知的鱼类GH序列都有较高的同源性 ,特别是与相同目的鱼类序列相比。通过序列比对 ,在这些蛋白序列内鉴定了许多保守的氨基酸残基 ,其中的大多数聚集而成 5个保守域。基于这 6种鱼类序列的编码区和其他鱼类的GH编码序列进行分子系统学分析 ,结果 (MP和NJ树 )与根据形态特征构建的系统发育树基本一致 ,特别是在硬骨鱼类较大分类阶元 (目间、目以上 )的系统发育研究方面?

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