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秀丽白虾3个地理种群mtDNA 16S rRNA基因序列变异及遗传分化

文献类型: 中文期刊

作者: 张敏莹 1 ; 徐东坡 2 ; 方弟安 2 ; 周彦锋 2 ; 刘凯 3 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部长江下游渔业资源环境科学观测实验站

2.;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部长江下游渔业资源环境科学观测实验站

3.;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部长江下游渔业资源环境科学观测实验站;

关键词: 秀丽白虾;地理种群;16S rRNA基因;序列变异;遗传分化

期刊名称: 大连海洋大学学报

ISSN: 2095-1388

年卷期: 2018 年 33 卷 03 期

页码: 323-328

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为探究秀丽白虾Exopalaemon modestus不同地理种群的遗传变异,采用PCR产物纯化测序的方法,分别测定了太湖、鄱阳湖和兴凯湖3个种群共计129个秀丽白虾样品的mtDNA 16S rRNA基因序列。结果表明:在486 bp序列中,检测到10个变异位点,占所测序列的2.06%;共发现8种单倍型,其中太湖种群5种,鄱阳湖种群4种,兴凯湖种群1种;单倍型Ⅰ为太湖和鄱阳湖种群共有,单倍型Ⅳ为鄱阳湖和兴凯湖种群共有,3个种群未有共享单倍型;平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.691 00和0.002 46,遗传多样性较低;AMOVA分析显示,3个种群间的遗传变异为29.58%,种群内的遗传变异为70.42%,遗传分化系数(Gst)为0.295 8,基因流(Nm)为0.595 2,3个种群间遗传分化存在极显著性差异(P<0.01)。本研究结果可为秀利白虾种质资源保护提供基础数据。

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