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军曹鱼淋巴囊肿病毒的系统关系研究及基因型分析

文献类型: 中文期刊

作者: 闫秀英 1 ; 孙修勤 2 ; 吴淑勤 3 ; 吴谡琦 2 ; 张进兴 2 ; 洪旭光 2 ; 郑凤荣 2 ; 曲凌云 2 ;

作者机构: 1.中国海洋大学

2.国家海洋局第一海洋研究所

3.中国水产科学研究院珠江水产研究所

关键词: 虹彩病毒;淋巴囊肿病毒军曹鱼分离株(LCDV-RC);系统关系;基因型

期刊名称: 高技术通讯

ISSN: 1002-0470

年卷期: 2007 年 17 卷 010 期

页码: 1087-1091

收录情况: EI ; 北大核心 ; CSCD

摘要: 从患淋巴囊肿病的养殖军曹鱼肿瘤中分离到一种虹彩病毒,命名为淋巴囊肿病毒军曹鱼分离株(LCDV-RC).为探讨LCDV-RC的系统地位,从DNA水平上分析了该病毒株与淋巴囊肿病毒中国牙鲆分离株(LCDV-CN)、淋巴囊肿病毒韩国鲈鱼分离株(LCDV-SB)、淋巴囊肿病毒日本牙鲆分离株(LCDV-JF)、淋巴囊肿病毒欧洲分离株(LCDV-1)和淋巴囊肿病毒日本岩鱼分离株(LCDV-RF)的系统关系.以核衣壳蛋白(MCP)基因为分子标记,通过PCR扩增和克隆测序获得了长度为1356BP的含178个信息位点的MCP基因序列;用最大简约法、最大似然法、邻接法和BAYESIAN法构建了分子系统树并进行了置信度检验.结果表明,构建的淋巴囊肿病毒ML、NJ、MP和BAYESIAN系统树的拓扑结构一致,LCDV-RC和LCDV-SB聚为一支,LCDV-CN和LCDV-JF聚为一支,LCDV-1和LCDV-RF分别各为一支.在35种虹彩病毒的系统关系分析中,LCDV-RC与另5株淋巴囊肿病毒在系统树上聚为一大支,说明LCDV-RC与淋巴囊肿病毒的关系近于其他虹彩病毒.根据遗传距离和系统关系分析认为,LCDV-RC属于一种新的基因型,称其为淋巴囊肿病毒Ⅳ型基因型.

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