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黄鳍鲷基因组微卫星的分离

文献类型： 中文期刊

作者： 夏军红 1 ; 朱彩艳 1 ; 苏天凤 1 ; 江世贵 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词： 黄鳍鲷;基因组;微卫星

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2007 年 14 卷 02 期

页码： 321-325

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用磁珠富集法构建黄鳍鲷(Acanthopagrus latus Houttuyn)基因组微卫星富集文库。共挑选60个克隆进行测序,分析发现58个克隆分别含(GA)n或(CA)n两碱基重复单元。进一步通过序列比对,最终获得41个具有特异微卫星序列的阳性克隆。其中,23个克隆含有(GA)n或(CT)n两碱基重复序列,17个克隆含有(GT)n或(CA)n重复序列,另1个含有以上两种重复类型。获得的微卫星序列中,单一型及间断型序列各有20条,另有1条属于复合型序列。序列长度为117~512 bp,平均259 bp。微卫星核心序列两碱基重复5到38次,绝大多数序列重复次数大于10。基于微卫星两端的侧翼序列设计并获得了3对能够在黄鳍鲷基因组有效扩增的微卫星引物。本研究旨为进一步开展黄鳍鲷分子育种及资源评价分析提供基础资料。

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