文献类型： 中文期刊

作者： 王瑞雪 ¹ ; 刘佳森 ¹ ; 李蕴华 ¹ ; 成立新 ¹ ; 岳林芳 ¹ ; 马万山 ¹ ; 赵艳红 ² ;

作者机构： 1.内蒙古自治区农牧业科学院畜牧研究所

2.内蒙古农业大学动物科学学院

关键词： 苏尼特羊;lncRNA;肌肉;差异表达

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 001 期

页码： 51-61

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为鉴定和分析苏尼特羊肌肉不同发育时期lncRNA的差异表达,利用RNA-seq技术对120d苏尼特羊胎儿和5月龄羔羊肌肉组织进行了lncRNA比较分析,筛选出差异表达的lncRNA及其靶基因,并对预测的mRNA进行了GO和KEGG分析,同时对随机筛选的差异表达lncRNA进行qRT-PCR验证。结果显示,120d和5月龄羔羊肌肉之间差异表达的lncRNA数共为626个,共靶向1 273个mRNA编码基因。GO和KEGG分析表明,这些差异基因主要涉及代谢过程的调控,生物合成,基因表达,蛋白结合以及mTOR信号通路、FoxO信号通路、胰岛素信号、肌动蛋白细胞骨架的调节、Wnt信号通路和间隙连接等信号通路。qRT-PCR验证证明,随机选取的8个lncRNA在肌肉组织中的表达量与RNA-seq结果一致。综上,本研究利用RNA-Seq技术分析了苏尼特羊120d胎儿和5月龄羔羊的差异表达lncRNA及其靶基因,发现其参与了不同生长时期苏尼特羊的肌肉发育和生长过程,为从lncRNA的角度更好地理解苏尼特羊肌肉生长发育的遗传调控机制提供了理论基础,也为绵羊分子辅助育种提供参考。