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乌拉尔图小麦全基因组NBS-SSR位点分析及标记开发

文献类型: 中文期刊

作者: 乔麟轶 1 ; 畅志坚 2 ; 张晓军 2 ; 刘静 3 ; 朱艳 3 ; 詹海仙 2 ; 郭慧娟 2 ; 李欣 2 ;

作者机构: 1.山西大学生命科学学院

2.山西省农业科学院作物科学研究所/作物遗传与分子改良山西省重点实验室

3.山西大学生物工程学院

关键词: 乌拉尔图小麦;NBS类基因;SSR标记;抗病

期刊名称: 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN: 1671-8151

年卷期: 2017 年 37 卷 03 期

页码: 153-157

摘要: [目的]本研究旨在诊断乌拉尔图小麦NBS家族所在基因组序列的SSR位点,并为抗源的发掘和利用开发分子标记。[方法]利用NBS隐马模型文件检索数据库获得目标序列,通过软件诊断序列SSR位点并开发标记,利用乌拉尔图小麦抗白粉病材料UR207和感病材料UR203进行标记验证。[结果]本研究从乌拉尔图小麦全基因组中分离出463个NBS基因,分为N、CN、NL和CNL共4类。从NBS所在scaffold序列上发现4 292个SSR位点,以二碱基重复位点最多,占78.1%。随机开发了42个分布于各染色体臂的TuNBS-SSR标记,有12个标记在UR207和UR203间存在多态性。[结论]本研究从乌拉尔图小麦全基因组中诊断出4 292个NBS-SSR位点,开发的12个标记在抗感材料间有多态性,可用于乌拉尔图小麦材料抗病性鉴定和抗病基因筛选。

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[1]小麦全基因组NBS类R基因分析及2AL染色体NBS-SSR特异标记开发. 乔麟轶,常建忠,郭慧娟,高建刚,郑军,畅志坚. 2016

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