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4种不同土壤微生物DNA提取方法对DGGE分析微生物群落的影响

文献类型： 中文期刊

作者： 吕新 1 ; 陈丽华 1 ; 李玥仁 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院中心实验室

关键词： 土壤微生物;DNA提取;变性梯度凝胶电泳

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2012 年 27 卷 04 期

页码： 367-372

摘要： 分别应用高盐法、玻璃珠破碎法、冻融法和试剂盒法4种不同土壤微生物DNA提取方法提取水稻稻田土壤微生物DNA,并通过细菌16SrRNA V3区通用引物GC338f-530R和真菌18SrRNA特异性引物NS1-GCFung进行PCR扩增结合变性梯度凝胶电泳(CGGE)分析,对4种DNA提取方法进行评价。结果表明,玻璃珠破碎法和试剂盒法提取的DNA均能满足土壤微生物多样性分析的要求;其中试剂盒方法操作简单,提取的DNA质量较高,但DNA产量较低且成本昂贵;玻璃珠破碎法用时较长,步骤繁琐,DNA产量较高,纯度较低,但对后续PCR扩增和DGGE分析没有明显影响,且成本低廉。

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