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黄瓜核心种质白粉病抗性的全基因组关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 贾会霞 1 ; 李锡香 1 ; 宋江萍 1 ; 林毓娥 2 ; 张晓辉 1 ; 邱杨 1 ; 阳文龙 1 ; 娄群峰 3 ; 王海平 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室

2.广东省农业科学院蔬菜研究所广东省蔬菜新技术研究重点实验室

3.作物遗传与种质创新国家重点实验室

关键词: 黄瓜;白粉病;全基因组关联分析;单核苷酸多态性;候选基因

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2021 年 007 期

页码: 1371-1385

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以231份来自世界各地的黄瓜核心种质为材料,于2017和2018年在北京和广州进行白粉病抗性鉴定,利用基因组重测序检测的950 382个SNPs进行全基因组关联分析。结果表明,黄瓜白粉病在广州地区的自然发病率显著高于北京地区,不同种质在两年病情指数(DI)之间存在较高的相关性;基于混合线性模型,共检测到12个显著关联信号,分布于1号、5号和6号染色体上,其中,pm1.1在北京的两年中被重复检测到,pm5.7在广州的两年中被重复检测到;显著关联信号中共有68个超过阈值[–log10(P value)=6.0]的SNP,包含1个外显子区非同义突变SNP(Chr5:16 676 542),位于编码异嗜性和多嗜性逆转录病毒受体蛋白基因XPR(Csa5G471600)上;在与白粉病抗性相关联SNP的LD区段内共检测到63个候选基因,其中7个候选基因的表达量在高抗材料接种白粉病前后出现显著差异。

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