文献类型： 中文期刊

作者： 徐鹏 ¹ ; 蔡继鸿 ¹ ; 杨阳 ¹ ; 郭琪 ¹ ; 张香桂 ¹ ; 徐珍珍 ¹ ; 沈新莲 ¹ ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花油菜重点实验室

关键词： 陆地棉;耐盐;转录组;EST-SSR标记;EST-InDel标记;差异表达基因

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2016 年 28 卷 01 期

页码： 65-74

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究。本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁迫前后根、叶总RNA的混样进行了转录组测序,对不同盐处理时期Miscott 7913-83和苏12根和叶分别进行表达谱分析。获得3232条盐胁迫下差异表达基因;基于差异表达基因利用生物信息学手段大规模开发了SSR以及In Del等分子标记;随机选择了部分SSR及In Del引物进行验证,进一步证实了分子标记的准确性。本研究为快速开发陆地棉品种间多态性分子标记提供了高效可行的分析方法,通过开发陆地棉耐盐相关功能标记,以期用于分子标记辅助育种改良陆地棉耐盐性。