文献类型： 中文期刊
作者： 王且鲁 1 ; 刘奕 1 ; 宋红梅 1 ; 汪学杰 1 ; 刘超 1 ; 牟希东 1 ; 胡隐昌 1 ; 罗建仁 1 ;
作者机构： 1.农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室
关键词： 双须骨舌鱼(Osteoglossum bicirrhosum);转录组;EST-SSR
期刊名称： 淡水渔业
ISSN： 1000-6907
年卷期： 2016 年 46 卷 06 期
页码： 8-13
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 利用MISA软件对双须骨舌鱼(Osteoglossum bicirrhosum)性腺转录组测序获得的188 461条Unigene进行SSR检测,结果在11 917个Unigene中共检测到SSR位点12 578个,其中包含2个及以上SSR位点的Unigene有633个。SSR的发生频率为6.32%,平均分布距离为9 949 bp。在筛选到的SSR位点中,优势重复基序为二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸,其中二核苷酸重复基序数量最多,占总数的50.52%。重复基元类型共216种,其中数量最多的类型为二核苷酸重复AC/GT,占总数的20.66%。从所有筛选出的SSR位点中随机选取50个位点并运用Primer Premier 5.0设计引物,共有25对引物成功扩增出特异性产物,并且均在同科的美丽硬仆骨舌鱼(Scleropages formosus)的三个亚种中通用。结果表明,转录组测序产生的EST序列是开发SSR标记的有效来源,开发所得EST-SSR引物可用于双须骨舌鱼及其近缘物种遗传分析、遗传图谱构建以及分子标记辅助育种等工作中。
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