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掌叶覆盆子染色体计数及基因组大小测定

文献类型: 中文期刊

作者: 金亮 1 ; 李春楠 1 ; 詹书侠 1 ; 李小白 1 ; 华金渭 1 ;

作者机构: 1.浙江省园林植物与花卉研究所;杭州市农业科学研究院;浙江省农业科学院园艺研究所;丽水市农林科学研究院

关键词: 掌叶覆盆子;染色体数目;基因组大小;流式细胞术;K-mer分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2022 年 20 卷 018 期

页码: 6009-6014

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 掌叶覆盆子(Rubus chingii Hu)是重要的药用植物,由于基因组数据缺乏,导致其分子生物学研究进展相对缓慢.本研究采用根尖染色体制片技术来确定其倍性;利用流式细胞术和K-mer分析方法对其基因组大小进行了测定.结果如下,掌叶覆盆子根尖染色体数目为2n=2x=14;采用流式细胞术,以萝卜'Saxa'为内标测定的掌叶覆盆子基因组大小为(255.39±7.58)Mb;K-mer分析估测的掌叶覆盆子基因组大小为262.2 Mb,杂合率为0.91%,重复序列比例为42.54%;根据各分析指标,推测该掌叶覆盆子基因组为一般复杂基因组.本研究结果将为掌叶覆盆子的全基因组测序研究提供重要参考.

  • 相关文献

[1]DNA流式细胞术在植物遗传及育种中的应用. 金亮,徐伟韦,李小白,刘建新,田丹青. 2016

[2]鲜食掌叶覆盆子种植技术. 金亮,李小白,江景勇,陈珍,曹群阳,赵张建. 2023

[3]瓠瓜基因组测定. 吴新义,徐沛,吴晓花,汪宝根,鲁忠富,李国景. 2016

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