文献类型： 中文期刊
作者： 吕世杰 1 ; 陈付英 1 ; 金磊 1 ; 张子敬 1 ; 朱肖亭 1 ; 施巧婷 1 ; 辛晓玲 1 ; 楚秋霞 1 ; 柏中林 1 ; 王二耀 1 ; 徐照学 1 ;
作者机构： 1.河南省农业科学院畜牧兽医研究所
关键词： 南阳牛;生长性状;候选基因;选择性清除;遗传分化系数
期刊名称： 畜牧兽医学报
ISSN： 0366-6964
年卷期： 2020 年 004 期
页码： 713-721
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 旨在探究安格斯牛生长相关的受选择基因,为肉牛生长相关主效基因的鉴定提供参考.本试验共采集72头南阳牛母牛和14头黑安格斯牛母牛血样并提取基因组DNA.利用SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing)技术获得全基因组SNP标记并对试验个体基因型进行分型.通过计算各SNP位点的遗传分化系数(Fst值)和核苷酸多态性(πratio)筛选两品种间的差异基因组区域,并与动物QTL数据库中牛生长性状QTLs进行比对,重合区域作为候选区域.随后对候选区域内基因进行功能注释以筛选候选基因,并根据"Expression Atlas"数据库对候选基因的组织表达情况进行分析.经筛选后,本试验共得到69 762个SNPs,以Fst值和πratio值的99%分位数为阈值筛选得到33个两品种间高度差异的基因组区域,其中16个基因组区域与生长性状相关QTLs重合.这些区域共包含27个基因,其中4个基因(FXR1、ADAR、IGF1和MNF1)与骨生长、肌肉发育和生长调控有关.FXR1和MNF1均在骨骼肌组织中高表达,ADAR和IGF1分别在脑组织和肝脏中表达最高.结果提示,IGF1基因可作为影响肉牛生长的关键候选基因,FXR1、ADAR、MNF1基因可优先进行进一步验证研究.
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