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基于全基因组重测序数据评估信阳水牛保种效果

文献类型: 中文期刊

作者: 魏稚彤 1 ; 高攀 2 ; 高腾云 3 ; 祁兴磊 4 ; 王二耀 5 ; 张子敬 5 ; 刘贤 6 ; 梁栋 3 ; 付彤 3 ;

作者机构: 1.河南农业大学

2.泌阳县农业综合行政执法大队中心

3.河南农业大学动物科技学院

4.泌阳县畜牧技术服务中心

5.河南省农业科学院畜牧兽医研究所

6.河南省畜牧总站

关键词: 信阳水牛;全基因组重测序;遗传多样性;ROH

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2025 年 61 卷 002 期

页码: 150-156

收录情况: 北大核心

摘要: 为了解信阳水牛的种质资源现状,本研究利用全基因组重测序技术,对30头信阳水牛基因组遗传多样性、群体遗传结构和连续纯合片段(Runs of Homozygosity,ROH)等指标进行分析,评估其保种效果。结果如下:信阳水牛遗传多样性丰富,最小等位基因频率为0.195,平均多态信息含量为0.277,平均期望杂合度为0.280,平均观察杂合度为0.269,平均核苷酸多样性为2.586。家系分析将30头信阳水牛分为6个家系;30头信阳水牛个体共检测到3578个ROH,长度在0~0.5Mb的ROH片段占比最多,基于ROH值计算的群体近交系数范围介于0.000 4~0.091 9,平均近交系数为0.020 1。综上,信阳水牛群体遗传多样性较为丰富,整体上保持了较低的近交水平,保种效果良好,建议后续适当引入新血缘与少数高近交水平个体交配。

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