文献类型： 中文期刊

作者： 王开杰 ¹ ; 徐永江 ¹ ; 崔爱君 ¹ ; 柳学周 ¹ ; 姜燕 ¹ ; 王滨 ¹ ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所;青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室;浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心

关键词： 高体(鱼师);线粒体基因组;序列比较分析;系统发育分析

期刊名称： 海洋与湖沼

ISSN： 0029-814X

年卷期： 2022 年 01 期

页码： 120-132

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为快速有效鉴别(鱼师)属鱼类物种、加强(鱼师)鱼遗传多样性管理与种质资源保护,通过Illumina测序技术,获得了东海海域养殖高体(鱼师)(Seriola dumerili)线粒体基因组全序列(16 530bp),碱基组成为A (26.83%)、G (17.6%)、C (30.04%)和T (25.53%), A+T含量为52.36%,且非编码控制区(D-loop)A+T富含61.64%,表现明显的AT偏好性。与其他硬骨鱼一样,高体(鱼师)线粒体基因组包含13条蛋白编码基因, 22个tRNA基因, 2个rRNA基因,除ND6、tRNA~(Gln)、tRNA~(Ala)、tRNA~(Asn)、tRNA~(Cys)、tRNA~(Tyr)、tRNA~(Ser)、tRNA~(Glu)、tRNA~(Pro)基因外,其余均位于H链编码;蛋白编码基因中,除COⅠ、COⅡ和ND5的起始密码子分别为ATC、ATA和ATA外,其余10个蛋白编码基因的起始密码子均为ATG,以典型的TAA和TAG为终止密码子,在ND4和Cytb中存在不完全密码子T;除tRNA~(Ser)-GCT外,其余21个tRNA均为典型三叶草二级结构。比较中国和日本海域高体(鱼师)线粒体基因组发现, CO Ⅰ、CO Ⅱ和ND5蛋白编码基因在起止位置、片段长度及起止密码子上存在显著差异。此外,与同属的黄条(Seriola aureovittata)和五条(鱼师)(Seriola quinqueradiata)的线粒体基因组13个蛋白编码基因进行两两对比分析,结果表明3种(鱼师)属鱼类的蛋白编码基因的相似性在85%～100%之间。基于线粒体基因组全序列构建的系统发育树,成功将高体(鱼师)与其他(鱼师)属鱼类有效区分,高体(鱼师)与长鳍(鱼师)同属一支,亲缘关系最近;黄条(鱼师)和五条(鱼师)聚为一支,亲缘关系最近。