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猪NOX1基因启动子区转录因子的筛选与鉴定

文献类型: 中文期刊

作者: 汪亮 1 ; 李忠秋 1 ; 何鑫淼 1 ; 王文涛 1 ; 唐晓东 2 ; 刘娣 1 ; 张冬杰 1 ;

作者机构: 1.黑龙江省农业科学院  

2.黑龙江省农业科学院

关键词: 猪;NOX1基因;启动子;调控因子

期刊名称: 中国兽医学报

ISSN: 1005-4545

年卷期: 2021 年 011 期

页码: 2268-2274

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了寻找调控猪NADPH氧化酶1(NOX1)基因转录的转录因子,本研究采用3′端固定,5′端逐渐截短的方法,扩增了NOX1基因的启动子区序列,并将它们分别连入双荧光素酶报告基因载体,转染PK15细胞后,检测双荧光素酶的相对活性。根据活性高低判定转录因子可能结合的位置,利用重叠PCR技术定点缺失转录因子的结合序列,再次连入报告载体后,根据荧光素酶活性的变化判定是否为NOX1基因真正的转录调控因子。结果发现,NOX1基因启动子区的-1 618~-1 bp区间存在转录调控因子的结合位点,对该区间开展2轮截短试验后,初步判定-1 149~-1 091 bp和-208~-115 bp区间存在正调控元件,-1 091~-1 052 bp区间存在负调控元件。针对上述3个区间,同时结合在线软件的预测结果,定向缺失了-1 104~-1 092 bp,-1 051~-1 043 bp,-1 043~-1 033 bp和-126~-116 bp小片段后,确定-1 104~-1 092 bp和-126~-116 bp区间存在正调控该基因转录的元件结合位点,分别为ZNF384、ELF-1和TBR1。本研究克隆了猪NOX1基因的启动子序列,对可能结合到该区间的转录因子进行了筛选与分析,为后续分析NOX1的转录调控机制,探讨其生物学功能奠定了基础。

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