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褐家鼠汉坦病毒黑龙江SC106分离株S基因特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈淑红 1 ; 彭永刚 2 ; 陈露菲 3 ; 刘娣 1 ; 刘彦成 3 ; 杨明 3 ; 王开利 3 ; 张静 3 ; 李冀宏 3 ;

作者机构: 1.黑龙江省农业科学院博士后科研工作站

2.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所

3.黑龙江省疾病预防控制中心

关键词: 褐家鼠;汉坦病毒;S基因;特征

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2010 年 32 卷 08 期

页码: 638-640

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究家鼠型(SEO)汉坦病毒(HV)黑龙江分离株的分子特征,本研究对黑龙江省SEO型新分离株SC106的S基因进行了扩增和序列分析。结果表明:SC106株S基因全长由1775nt组成,编码的蛋白长429aa,符合SEO型编码。与HV参考毒株进行比较,SC106与SEO型同源性最高,与姬鼠型(HTN)相对较低,与其它型别同源性更低。N蛋白进化树分析表明,SC106位于SEO型病毒所在支系,与河南株R22,黑龙江株Pf26和北京株BjHD01亲缘关系接近,体现了一定的宿主依赖性和地理簇集性。序列分析表明:SC106与黑龙江省首个SEO型分离株Pf26均为SEO型中的S1亚型,它们的S基因核苷酸序列同源性也最高(99.2%),并且SC106的S基因编码的N蛋白氨基酸序列也比较保守,由此证实,HV的进化与时间关系不大。

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