文献类型： 中文期刊

作者： 倪黎纲 ¹ ; 赵旭庭 ¹ ; 王宵燕 ¹ ; 宋成义 ¹ ; 吴信生 ¹ ; 甘源 ¹ ;

作者机构： 1.扬州大学动物科学与技术学院;江苏农牧科技职业学院;江苏省农业科学院兽医研究所

关键词： 姜曲海猪;猪肺炎支原体;高通量测序;miRNA表达谱

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2019 年 12 期

页码： 1979-1986

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探明姜曲海猪感染肺炎支原体后肺组织miRNA(microRNA)表达谱和分子机制,选取50日龄姜曲海猪为实验猪,随机分成感染组和对照组,人工感染肺炎支原体28 d后,采集肺部组织,进行高通量miRNA测序,采用生物信息学软件进行miRNA鉴定和靶基因预测。结果显示:感染组和对照组的肺组织分别筛选到14 265 786条和14 000 588条小RNA纯净序列(clean reads)。与对照组相比,感染组中筛选到73个显著差异表达的miRNAs,其中39个表达上调,34个表达下调,从中随机选取4个miRNAs进行定量PCR(quantitative real time PCR,qRT-PCR)验证,感染组和对照组的表达水平与测序结果基本一致。73个差异表达miRNAs预测到1 685个靶基因和4 220个靶位点,靶基因预测筛选到8个与免疫调控相关的miRNAs。靶基因GO(gene ontology)分析显示,miRNA广泛参与生物过程、细胞组成和分子功能的调控。靶基因KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析显示,miRNA参与调控细胞凋亡、ECM受体相互作用、粘附斑通路等信号通路。本研究通过高通量测序获得姜曲海猪感染肺炎支原体后肺组织miRNA表达谱,通过生物信息学分析筛选到与免疫调控相关的miRNAs和信号通路,为进一步阐明姜曲海猪的肺炎支原体感染机制奠定了基础。