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基于荧光定量PCR方法的中华鲟环境DNA获取优化

文献类型: 中文期刊

作者: 王肖静 1 ; 冯广朋 1 ; 王友保 1 ; 朱佳志 2 ; 姜伟 2 ; 张涛 3 ; 杨刚 3 ;

作者机构: 1.安徽师范大学生态与环境学院

2.三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室

3.中国水产科学研究院东海水产研究所

关键词: 中华鲟;滤膜材质;孔径大小;eDNA提取

期刊名称: 海洋渔业

ISSN: 1004-2490

年卷期: 2025 年 47 卷 004 期

页码: 524-533

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解环境DNA(eDNA)在不同水域、不同物种间的富集和提取效果,并优化分析检测方法,以室内海水养殖的中华鲟(Acipenser sinensis)为目标物种,采用qPCR方法,选择直径50 mm、孔径0.45 μm的混合纤维素膜、醋酸纤维素膜、玻璃纤维膜和聚丙烯膜共4种材质滤膜,通过3种DNA试剂盒提取中华鲟eDNA,比较其eDNA获取效果,同时评估较优滤膜的3种孔径(0.22、0.45、1.20 μm)的富集效果.结果表明,滤膜材质、孔径大小及DNA试剂盒对中华鲟eDNA获取具有显著影响.其中,0.45 μm混合纤维素膜富集的eDNA含量更多,且天根DNeasy Blood&Tissue Kit提取的eDNA含量更多,为(457.33±35.10)copies·μL-1.研究结果优化了一套针对中华鲟的eDNA技术操作流程,可为后期应用eDNA技术监测长江口中华鲟资源分布提供参考.

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