文献类型： 中文期刊

作者： 杨婉 ¹ ; 潘永 ² ; 杨阳 ¹ ; 张家莉 ¹ ; 令狐远凤 ¹ ; 陈世雄 ¹ ; 杨琦 ¹ ;

作者机构： 1.贵州大学动物科学学院

2.贵州省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 沙门氏菌;sRNA RybB;基因缺失;高通量测序;靶基因

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2024 年 011 期

页码： 8-14

收录情况： 北大核心

摘要： 为了探明沙门氏菌在sRNA RybB缺失后的转录组变化情况，试验对沙门氏菌LT2菌株和RybB基因缺失株进行高通量测序，运用DESeq2算法筛选sRNA RybB缺失后的差异表达基因，并对其进行GO功能注释、KEGG信号通路富集分析及EggNOG功能注释，并利用实时荧光定量PCR验证筛选出的10个差异表达基因结果的可靠性。结果表明：共筛选出199个差异表达基因，其中上调基因98个，下调基因101个。差异表达基因GO功能主要注释了酰胺转运、肽转运、大分子蛋白定位等生物学过程，参与了鞭毛组装、双组分系统、沙门氏菌感染、丙酸代谢和NOD样受体信号通路等27个KEGG信号通路，EggNOG功能注释了细胞壁/膜/包膜生物发生、一般功能预测、碳水化合物运输与代谢、氨基酸的转运和代谢等蛋白分类。差异表达基因STM1049、STM1246、STM4504、STM1394、STM1050、STM3600、STM3599、STM3601、STM3598和STM3602的相对表达量与转录组测序结果的变化趋势一致。说明sRNA RybB缺失后会影响细菌的生命活动，以及可直接或间接调节沙门氏菌的各种代谢途径。