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鲤春病毒糖蛋白(G)基因的分离及同源性比较

文献类型： 中文期刊

作者： 耿波 1 ; 孙效文 1 ; 牟振波 1 ; 梁利群 1 ; 欧阳红生 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

2.吉林大学

关键词： 鲤春病毒病;糖蛋白;序列同源性;分离株

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2006 年 S1 期

页码： 450-454

收录情况： CSCD

摘要： 通过RT-PCR和巢氏PCR方法从疑似鲤春病毒(SVCV)侵染的镜鲤肝组织中获得了鲤春病毒糖蛋白(G)基因。通过序列测定与分析,所获得的鲤春病毒糖蛋白(G)基因由606个核苷酸组成,编码一个由202个氨基酸组成的糖蛋白。通过NCBIblast与9个来自不同国家或地区的鲤春病毒糖蛋白(G)基因序列比对分析,发现获得的鲤鱼春季病毒糖蛋白G基因DNA序列与美国分离的AY527273株同源性最高为99.8%,与中国分离的AY842485株同源性次高为98.7%,与英国分离的两个序列SVI538065和SVI538066株的同源性为98.2%,而与其它国家的分离株如SVU18101、SVI318079、SVI538061、SVI538062、SVI538063的同源性最差,仅为89.4%~90.0%。氨基酸同源性分析结果与DNA同源性分析结果一致,所获得的鲤春病毒糖蛋白G基因氨基酸推导序列与其它9个分离株的氨基酸同源性在89.6%~99.5%之间。对SVCV不同分离株遗传变异和进化关系的分析为下一步开展SVCV快速诊断方法的研究和疫苗的研制奠定了基础。

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