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郑麦366α-醇溶蛋白基因的克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李文旭 1 ; 常阳 1 ; 杨攀 1 ; 王美芳 1 ; 何盛莲 1 ; 吴政卿 1 ; 雷振生 1 ; 晁岳恩 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院小麦研究所

关键词: 小麦;α-醇溶蛋白;克隆;生物信息学

期刊名称: 河南农业科学

ISSN: 1004-3268

年卷期: 2017 年 46 卷 01 期

页码: 13-18+25

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究优质强筋小麦品种郑麦366α-醇溶蛋白的组成,应用简并引物进行PCR扩增,从郑麦366中扩增得到13条核苷酸序列,其中9条序列推导的氨基酸序列具有完整的开放阅读框。进一步分析显示,克隆的9个基因(分别命名为ZM366-1—ZM366-9)编码的蛋白质均具有α-醇溶蛋白的典型结构特征,根据T-细胞毒性抗原表位数目和多聚谷氨酰胺区特征分别将ZM366-1、ZM366-2定位到6A染色体,ZM366-3、ZM366-4定位到6D染色体,ZM366-5—ZM366-9定位到6B染色体。蛋白质二级结构预测显示,克隆的9个α-醇溶蛋白都仅含有α-螺旋结构,其中B基因组α-醇溶蛋白的α-螺旋含量明显高于其他基因组。同源系统进化树分析表明,克隆的9个α-醇溶蛋白具有明显的基因组特异性。

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