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犬细小病毒CPV-SHZ分离株VP2基因的克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘志强 1 ; 钟发刚 2 ; 王新华 2 ;

作者机构: 1.石河子大学动物科技学院

2.新疆农垦科学院畜牧所基因工程实验室

关键词: 犬细小病毒;VP2基因;序列分析

期刊名称: 石河子大学学报(自然科学版)

ISSN: 1007-7383

年卷期: 2008 年 26 卷 03 期

页码: 311-315

摘要: 以本实验室分离鉴定犬细小病毒新疆石河子株(CPV-SHZ)的DNA为模板,根据基因库已发表CPV序列设计合成了VP2基因的1对特异引物,进行聚合酶链式反应,扩增出约1.7kb的片段,按常规方法克隆进pMD18-T载体,经EcoR I和Sal I双酶切筛选到阳性质粒。测序得到VP2全基因组序列,并登陆Genbank(EU170352)。进一步对该片段进行序列分析,结果表明:所扩增基因片段长度为1755bp,与CPV参考株毒株V154(Type2a)、LCPV-V204(Type2b)、LCPV-V139(Type 2c(a))、LCPV-V203(Type 2c(a)),其核苷酸的同源性分别为99.32%、98.75%、98.97%、98.69%,确定CPV-SHZ株基因型为2a型,将其同我国和世界其他国家主要分离株进行基因系统发生进化关系分析,结果表明,其与我国北京分离株BJ018/07亲缘关系较近。

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