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小果野蕉(Musa acuminata)全基因组NBS抗病基因的鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘梦雅 1 ; 李伟明 2 ; 吴伟 3 ; 葛学军 4 ;

作者机构： 1.中国科学院华南植物园

2.中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室

3.中国科学院大学

4.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

关键词： 小果野蕉;生物信息学;基因组;NBS抗病基因

期刊名称： 热带亚热带植物学报

ISSN： 1005-3395

年卷期： 2014 年 05 期

页码： 60-68

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨小果野蕉(Musa acuminata)中NBS基因的功能,基于新近发表的小果野蕉全基因组序列,对NBS基因家族进行鉴定、分类和染色体定位,解析基因的复制特征、系统发育关系及上游启动子调控元件类别,推测这些基因在小果野蕉中可能的功能。结果表明,在小果野蕉全基因组中鉴定出125个NBS基因,包括78个标准和47个非标准NBS基因。多数NBS基因在染色体上以基因簇形式存在,串联复制是NBS基因家族扩张的主要动力。系统发育分析表明标准NBS基因形成两大分支,77个标准NBS基因有EST表达支持。这为群体水平的抗病基因型筛选提供了本底信息,促进栽培香蕉分子抗病育种进程。

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