您好，欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库！
中国水产科学研究院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

养殖沉积环境中气单胞菌属细菌的实时荧光定量PCR检测方法的建立

文献类型： 中文期刊

作者： 姜娓娓 1 ; 李秋芬 2 ; 刘淮德 2 ; 李晓龙 2 ;

作者机构： 1.中国海洋大学海洋生命学院

2.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： GyrB基因;沉积环境;气单胞菌属;实时荧光定量PCR

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 1000-7075

年卷期： 2014 年 35 卷 03 期

页码： 126-133

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用GyrB基因的特异性引物建立沉积环境中气单胞菌属细菌的实时荧光定量PCR检测方法。将已知浓度的气单胞菌菌液加入灭菌的沉积物样品中,作为模拟沉积物样品。通过选择和优化沉积物DNA提取方法、特异性引物、标准曲线模板,建立沉积环境中气单胞菌属细菌准确检验的实时荧光定量PCR方法,同时验证该方法的特异性、灵敏性、重复性。结果表明,采用改进的溶菌酶-SDS温和裂解法提取沉积物DNA,以扩增GyrB基因片段的IAF和IAR为特异性引物,并直接以模拟沉积物样品DNA为标准品构建标准曲线,可以建立适用于定量检测沉积环境中气单胞菌属细菌的实时荧光定量PCR方法。该方法可灵敏、特异、准确地定量检测刺参养殖池塘底泥中气单胞菌属中不同种的细菌,检出效率可达103CFU/g。统计分析显示,变异系数为0.21%-0.80%,均小于5%,表明重复性良好。

  • 相关文献

[1]草鱼养殖模式对气单胞菌属细菌群落影响分析. 徐先栋,付辉云,欧阳敏,万国湲,饶毅,黄江峰,周智勇,刘礼辉. 2021

[2]泥鳅溃疡病及病原温和气单胞菌生物学及分子特征研究. 张晓君,邴旭文,姚东瑞,朱明,秦国民. 2010

[3]杂交鳢(斑鳢♀×乌鳢♂)内脏类结节病病原菌的分离、鉴定与特性分析. 刘春,李凯彬,王庆,常藕琴,梁慧丽,王芳,潘德博,石存斌,吴淑勤. 2012

[4]泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)病原霍乱弧菌(Vibrio cholerae)的表型与分子鉴定. 邴旭文,阎斌伦,张晓君,秦蕾,毕可然. 2009

[5]鲤病原鳗利斯顿氏菌的分离鉴定及生物学特性研究. 张晓君,阎斌伦,邴旭文,毕可然,秦蕾,秦国民. 2009

[6]大口黑鲈源维氏气单胞菌的分离鉴定. 杨超,董浚键,刘志刚,孙成飞,赵飞,叶星. 2021

[7]异育银鲫病原温和气单胞菌表型及分子鉴定与溶血素基因检测. 张晓君,阎斌伦,邴旭文,秦蕾,秦国民. 2010

[8]鱼致病性舒伯特气单胞菌双重PCR检测方法的建立. 刘春,李凯彬,王庆,王芳,曾伟伟,石存斌,吴淑勤. 2014

[9]泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)病原温和气单胞菌(Aeromonas sobria)分子鉴定及耐药性研究. 姚东瑞,邴旭文,朱明,毕可然,陈丽,张晓君. 2010

[10]草鱼铜绿假单胞菌的鉴定及药物敏感性分析. 崔来宾,叶星,邓国成,江小燕,田园园,白俊杰,黎坚平. 2010

[11]冲绳海槽中部沉积物物质来源和沉积环境分析. 张丹丹,曾志刚,殷学博. 2017

[12]胶州湾大沽河河口近岸海域短时间尺度沉积动力过程. 陈小英,刘金庆,郭磊,刘晓磊,印萍. 2016

[13]渤海南部早-中更新统湖相沉积的粒度特征及其对沉积环境的指示. 吕文哲,易亮,付腾飞,陈广泉,徐兴永,于洪军. 2017

[14]威海南部近岸泥质区晚更新世以来的沉积环境演化. 刘金庆,印萍,陈小英,曹志敏,王松涛,吴振,宋委. 2016

[15]中全新世以来南黄海岩心记录的沉积环境演变对东亚季风的响应. 皮仲,李铁刚,南青云. 2016

[16]渤海东部与黄海北部表层沉积物的粒度特征及其沉积环境. 张剑,李日辉,王中波,张训华,黄龙,孙荣涛. 2016

[17]南黄海盆地中部隆起上古生界沉积环境探讨. 蔡来星,郭兴伟,徐朝晖,张晓华,李文强,肖国林,朱晓青,侯方辉. 2018

[18]台湾东北部古海湾沉积特征. 安振振,李广雪,丁咚,徐继尚,马妍妍,闵建雄,王丽艳,张剑. 2018

[19]日本海百年来沉积速率及粒度指示意义. 宗娴,石学法,葛晨东,邹建军,Sergey Gorbarenko,乔淑卿,董智. 2016

[20]南黄海底栖有孔虫组合对1855年黄河改道的响应. 范尧,范德江,郑世雯,龙海燕,张喜林,田元. 2019

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国水产科学研究院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台