您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

菲律宾蛤仔GST基因家族的全基因组鉴定及急性盐度胁迫下的表达特征

文献类型: 中文期刊

作者: 蒋欣月 1 ; 周丽青 1 ; 孙秀俊 1 ; 井浩 1 ; 葛广玉 1 ; 吴彪 1 ; 刘志鸿 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室;上海海洋大学,水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室

关键词: 菲律宾蛤仔;RpGST基因家族;急性盐度胁迫;表达模式

期刊名称: 中国水产科学

ISSN: 1005-8737

年卷期: 2023 年 30 卷 009 期

页码: 1055-1066

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为阐明菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)谷胱甘肽转移酶(glutathione S-transferase,GST)基因(RpGST)家族特征及其在应对急性盐度变化中所起的作用,本研究通过生物信息学方法对RpGST基因家族进行了全基因组水平的鉴定、染色体定位、结构特征分析、进化分析和表达特征分析,共鉴定出7个RpGST基因家族成员,分别命名为 RpGSTA1、RpGSTA2、RpGSTA3、RpGSTA4、RpGST_C_3a、RpGST_N_M1、RpGST_N_M2.RpGSTs不均匀地定位在5条染色体上,其编码蛋白的理化性质呈现出不同程度的亲水性.RpGST蛋白均定位于细胞质中,该基因家族成员都具有谷胱甘肽转移酶结构域(PF00043、PF02798),表明RpGSTs蛋白参与抗氧化和解毒过程;系统发育分析显示,RpGSTs分为3个亚家族且在进化上保守.实时荧光定量分析显示,急性盐度胁迫菲律宾蛤仔0h、12 h和24 h后,急性高盐(40)胁迫下肝胰腺中RpGSTA和RpGSTNM亚家族的基因整体表达水平随时间逐步升高,RpGST_C_3亚家族的基因表达水平随时间先降低后升高;急性低盐(15)胁迫下肝胰腺中RpGSTA、RpGST_C_3a和RpGST_N_M亚家族的基因整体表达水平随时间逐步升高;急性低盐胁迫下谷胱甘肽转移酶表达量显著高于急性高盐胁迫,说明急性低盐胁迫对菲律宾蛤仔的影响大于急性高盐胁迫.以上研究结果明确了 RpGST基因家族的序列结构特征、系统进化以及对急性高盐和急性低盐胁迫的响应机制,证明RpGST基因家族在菲律宾蛤仔抗氧化和解毒过程中发挥了重要作用,为菲律宾蛤仔抗逆分子选择育种研究提供了理论依据.

  • 相关文献

[1]三疣梭子蟹蜕皮激素受体EcR基因的cDNA克隆及表达分析. 张晓燕,李健,刘萍,陈萍,孙铭,葛红星. 2014

[2]卵形鲳鲹AQP1a分子特征及其对急性盐度胁迫的表达响应. 赵超平,郭华阳,张健,朱克诚,郭梁,张楠,刘宝锁,杨静文,张殿昌. 2018

[3]急性盐度胁迫和慢性盐度驯化对马来西亚红罗非鱼存活及肌肉组分的影响. 何燕富,王兰梅,刘念,朱文彬,董在杰,杨慧,宋飞彪,陈兴婷. 2016

[4]急性盐度胁迫对卵形鲳鲹幼鱼Na~+-K~+-ATP酶活性和渗透压的影响. 范春燕,区又君,李加儿,于娜,苏慧,王刚. 2012

[5]菲律宾蛤仔养殖水体中主要污染物安全限量的研究. JIANG Chao-jun,姜朝军,QIAO Qing-lin,乔庆林,XU Jie,徐捷,CAI You-qiong. 2011

[6]菲律宾蛤仔大规格苗种培育技术研究. 陈百尧,杨健,龚琪本,唐兴本,伏光辉,时勤. 2009

[7]菲律宾蛤仔酶解产物的抑菌活性. 刘淇,谢沙,赵玲,曹荣,万慧一,魏玉西. 2013

[8]菲律宾蛤仔4个野生群体的同工酶分析. 葛京盈,刘萍,高天翔. 2008

[9]底播菲律宾蛤仔养殖区的质量安全环境风险评估——以胶州湾为例. 崔正国,陈碧鹃,曲克明,夏斌,梁峻,赵学伟. 2014

[10]两种蛤仔群体遗传多样性的形态参数及AFLP分析. 刘相全,包振民,胡景杰,何金霞,方建光,王如才. 2010

[11]基于GLM模型Logistic回归的菲律宾蛤仔地理群体判别. 董建宇,胡成业,杨晓龙,李文涛,张秀梅. 2018

[12]桑沟湾楮岛大叶藻床区域菲律宾蛤仔的生态贡献. 吴亚林,高亚平,吕旭宁,王晓芹,李凤雪,姜娓娓,王军威,张义涛,蒋增杰. 2018

[13]基于叶绿素a时空分布的胶州湾菲律宾蛤仔养殖容量评估. 董世鹏,蔺凡,姜娓娓,杜美荣,高亚平,李凤雪,侯兴,蒋增杰. 2020

[14]围隔生境下养殖密度对菲律宾蛤仔生长的影响. 潘渊博,孙秀俊,郭贺,林忠洲,徐建峰,周成旭. 2023

[15]菲律宾蛤仔重复序列28S RRNA及组蛋白H3基因的染色体定位. 卢素敏,包振民,张玲玲,孟庆磊,胡景杰,胡晓丽,刘慧,方建光. 2007

[16]不同地理群体菲律宾蛤仔壳形态对体重性状的影响研究. 王松林,许星鸿,涂康,刘志鸿,张天时,吴彪,周丽青,孙秀俊. 2023

[17]菲律宾蛤仔养殖水体中大肠菌群安全限量的研究. 徐捷,乔庆林,蔡友琼,姜朝军. 2005

[18]菲律宾蛤仔对0~#柴油和南海流花原油的生物富集动力学特征. 胡莹,马胜伟,陈海刚,张喆,张林宝,蔡文贵. 2017

[19]菲律宾蛤仔两种谷氧还蛋白基因对微生物侵染和重金属胁迫的应答. 张林宝,孙伟,蔡文贵,贾晓平. 2014

[20]10种麻痹性贝类毒素的固相萃取及液相色谱-串联质谱测定法. 于慧娟,蔡友琼,黄宣运,冯兵,史永富. 2015

作者其他论文 更多>>