文献类型： 中文期刊

作者： 冯恩友 ¹ ; 肖熙鸥 ² ; 林文秋 ² ; 莫定鸣 ¹ ; 冯晓赓 ¹ ; 马飞骏 ¹ ;

作者机构： 1.湛江市农业科学研究院

2.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

关键词： 茄子;SLAF-seq;遗传多样性;SNP位点

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 023 期

页码： 7940-7949

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究茄子种质资源的亲缘关系，本研究利用SLAF-seq （Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing）简化基因组测序对40份茄子高代自交系进行简化基因组测序，利用获得的SNP （Single nucleotide polymorphism）标记进行遗传结构分析。本研究共获得700 639个SLAF标签和1 248 593 SNPs。结果表明，SNP数量在每条染色体上和同一条染色上的不同位置差异较大，注释结果表明SNP和InDel主要发生在基因间隔区。利用获得的SNPs多样性可以将40份材料分为3个类群。SNP分类结果与根据青枯病抗性分类结果基本一致，而与根据果形果色分类结果不一致，通过筛选，获得了高质量的122个perfect SNPs。本研究结果为杂组合的选配提供了参考，同时所开发的SNP位点为KSAP高通量基因分型奠定了良好的基础。