您好,欢迎访问江苏省农业科学院 机构知识库!

猪链球菌4型GalR蛋白的生物信息学分析及原核表达

文献类型: 中文期刊

作者: 孙珂 1 ; 祝昊丹 1 ; 周俊明 1 ; 王丹丹 1 ; 俞正玉 1 ; 吕立新 1 ; 何孔旺 1 ; 李彬 1 ; 倪艳秀 1 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院兽医研究所

关键词: 猪链球菌4型(SS4);转录调控因子GalR;生物信息学;原核表达

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2021 年 002 期

页码: 443-449

收录情况: 北大核心

摘要: 试验旨在了解猪链球菌4型(Streptococcus suis serotype 4,SS4)转录调控因子GalR蛋白生物学信息并对其进行原核表达。使用相关生物信息学分析网站对SS4 SH1510菌株GalR蛋白进行序列同源性和功能结构域检索,并对信号肽、跨膜区和等电点进行预测;同时,对SS4 SH1510菌株GalR基因进行扩增、原核表达、纯化,并用SDS-PAGE分析重组蛋白的可溶性,用Western blotting鉴定重组蛋白的反应原性。氨基酸序列比对显示,SH1510菌株GalR蛋白与变形链球菌、无乳链球菌、绿脓杆菌、马链球菌兽疫亚种、肺炎链球菌、口腔链球菌及李斯特菌的GalR家族蛋白的氨基酸序列分别具有57%、56%、55%、55%、52%、52%和49%的同源性;结构域检索发现GalR蛋白N-末端具有螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix,HTH)基序的小DNA结合结构域,C-末端具有Ⅰ型周质结合蛋白折叠的调节配体结合域,在这两个功能结构域的中间含有一个约18-氨基酸的连接子;GalR蛋白无信号肽,无跨膜区,等电点为5.10。SDS-PAGE分析显示,GalR蛋白绝大部分表达在上清,分子质量为56 ku;Western blotting鉴定结果显示,His单克隆抗体和粗制SS4多克隆抗体兔血清能特异性识别可溶性GalR蛋白。本研究对GalR蛋白进行了生物信息学分析并成功地表达和纯化了GalR蛋白,为进一步研究GalR蛋白在SS4中的作用奠定了基础。

  • 相关文献

[1]玉木耳漆酶基因Aclac的克隆及原核表达. 苏文英,谭一罗,刘晓梅,杨和川,秦裕营,李晓,任立凯. 2021

[2]葡萄miR164家族生物信息学分析及靶基因预测. 王丽丽,葛金涛,刘兴满,赵统利. 2016

[3]类猪圆环病毒因子P1 VP2蛋白二级结构与B细胞表位预测. 温立斌,何孔旺,杨汉春,王玉然. 2009

[4]黄瓜MLO型基因家族成员的鉴定及生物信息学分析. 夏礼如,钱春桃. 2013

[5]甘蓝型油菜GPDH基因克隆、表达分析及植物过表达载体构建. 张超,付三雄,周小婴,唐容,黄莎,杨克相,戚存扣. 2019

[6]辣椒CaWRKY8基因克隆及胁迫下的表达分析. 刁玄章,王述彬,刁卫平,潘宝贵,戈伟,高青海. 2019

[7]甘蓝型油菜脂肪酶基因BnGLIP1的克隆与分析. 李明,丁丽娜,王政,曹维,王玉康,张洁夫,谭小力. 2020

[8]玉米SPP基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 何冰,时丕彪,吕远大,陈国祥. 2019

[9]大豆GmGLRs基因全基因组鉴定与表达分析. 崔晓霞,赵硕,郭书巧,束红梅,何晓兰,倪万潮,巩元勇,刘来华. 2019

[10]玉米ZmRab6A基因的克隆与生物信息学分析. 时丕彪,胡凤琴,顾小兵,吕远大. 2020

[11]一个新的葡萄抗逆转录因子VvERF2基因的In silico克隆及生物信息学分析. 高峰,熊爱生,彭日荷,李贤,蔡斌,薛永,付晓燕. 2008

[12]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017

[13]恶性高温综合征患猪基因表达变化及生物信息学分析. 方晓敏,涂枫,任守文,王学敏,李碧侠,付言峰,赵为民,赵芳. 2014

[14]甘薯长喙壳菌果胶酸裂解酶基因克隆及生物信息学分析. 张成玲,孙厚俊,唐伟,马居奎,杨冬静,陈晶伟,罗勤川,刘亚菊,谢逸萍. 2021

[15]瓠瓜KNOX基因家族全基因组鉴定及组织表达分析. 徐晓燕,黄小忠,刘万仙,张曼. 2024

[16]辣椒CaNAC55基因克隆与表达分析. 吴荡,刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,隋益虎. 2021

[17]猪Toll样受体4基因(TLR4)外显子SNP检测及生物信息学分析. 刘筱,方晓敏,任守文,李碧侠,王学敏. 2011

[18]甘薯黑斑病菌Cel61A基因克隆与表达分析. 罗勤川,孙厚俊,唐伟,谢逸萍,杨冬静,马居奎,陈晶伟,高方园,张成玲. 2023

[19]陆地棉PHYB基因生物信息学分析(英文). 沙琴,杨建红,巩元勇,郭书巧,束红梅,蒋璐,倪万潮. 2016

[20]甘薯等10种作物基因的生物信息学分析. 杨冬静,徐振,张成玲,孙厚俊,赵永强,谢逸萍. 2017

作者其他论文 更多>>