文献类型： 中文期刊
作者： 马玉飞 1 ; 李本强 1 ; 陶洁 1 ; 程靖华 1 ; 刘雷 1 ; 刘惠莉 1 ;
作者机构： 1.上海市农业科学院畜牧兽医研究所
关键词： 猪Delta冠状病毒;M基因;RT-PCR;进化分析
期刊名称： 上海农业学报
ISSN： 1000-3924
年卷期： 2020 年 36 卷 001 期
页码： 71-76
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了解猪Delta冠状病毒(Porcine deltacoronavirus,PDCoV)在发生腹泻疫情猪群中的感染情况,根据PDCoVM基因的保守序列设计了一对检测引物,建立了猪Delta冠状病毒的的检测方法,其最低核酸检测限量为3.92×103 copies/μL,特异性和灵敏度均较好.利用该方法对2015-2017年上海周边猪场的518份猪腹泻粪便样品进行检测,检测出25份PDCoV阳性样品,阳性感染率达4.8%.在所检出的阳性样本中,PDCoV与猪嵴病毒(Porcine kobuvirus,PKV)和猪星状病毒(Porcine astrovirus,PAstV)的混合感染率较高,分别为40%和48%;PDCoV与猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)混合感染率为8.0%,未检测到PDCoV与猪传染性胃肠炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus,TEGV)昆合感染的样本.随机选取10份PDCoV阳性样本,对扩增的M基因片段同源性进行分析,结果发现,10份样品中核苷酸同源性达95.0%-99.6%,与GenBank登录的PDCoV毒株的同源性为96.1%-100%,说明目前流行的PDCoV毒株的遗传差异不大,该研究可为了解PDCoV流行情况提供参考依据.
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