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利用PCR-RFLP技术分析拟穴青蟹抗菌肽基因SCY2的SNP位点

文献类型: 中文期刊

作者: 马洪雨 1 ; 马春艳 1 ; 张丹 1 ; 崔海玉 1 ; 蒋科技 1 ; 马凌波 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院东海水产研究所/农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室;上海海洋大学水产与生命学院

关键词: 拟穴青蟹;SCY2基因;PCR-RFLP技术;单核苷酸多态性(SNP)

期刊名称: 武汉大学学报(理学版)

ISSN: 1671-8836

年卷期: 2011 年 04 期

页码: 343-349

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究根据公布的锯缘青蟹SCY2基因序列设计引物SCY2-RFLPs和SCY2-RFLPa,利用PCR-RFLP技术分析了5个地理群体(宁德、汕头、万宁、东方、三亚)共计148个拟穴青蟹SCY2基因的多态性.结果表明,所扩增的SCY2基因片段含有2个StuⅠ内切酶识别位点,位于第一外显子的位点没有多态性,位于第一内含子的位点存在多态性.在148个个体中共检测到AA和AB两种基因型,等位基因B的出现频率非常低,只在三亚群体的1个个体中检测到,而在其他4个群体中均未检测到,其等位基因频率为0.003 4.序列分析结果表明,扩增片段长度为1 016 bp,包含部分5′非翻译区(282 bp)、第一外显子(131 bp)和部分第一内含子(603 bp).AA基因型表现为3条带(从大到小依次为509,356,151 bp),AB基因型表现为4条带(从大到小依次为660,509,356,151bp).B等位基因是由于867 bp处发生了C→G的单碱基突变导致StuⅠ内切酶失去了1个识别位点而形成的.

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