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猪圆环病毒2型XJ-SW株全基因组的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄新 1 ; 康立超 1 ; 韩猛立 1 ; 何延华 1 ; 钟发刚 1 ;

作者机构： 1.新疆农垦科学院畜牧兽医研究所

关键词： 猪圆环病毒2型;基因组;克隆;序列分析

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2012 年 05 期

页码： 461-466

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用PCR方法对采集自新疆沙湾地区某猪场的疑似仔猪多系统衰竭综合征病料猪圆环病毒2型(PCV2)全基因组进行了扩增,确定了2份病料中的PCV2的分子特征,命名为XJ-SW1、XJ-SW2(Gen-Bank登录号:JN639856,JN639857)。经对阳性样品进行克隆、测定,并应用软件进行全基因组核苷酸序列比对分析。结果显示,2株病毒的基因组全长均为1 768nt;XJ-SW1株与我国山东DE株(GenBank登录号:HM142897)的同源性最高(为97.91%);XJ-SW2株与韩国G2284株(GenBank登录号:JF317587)的同源性最高(为97.51%)。PCV2全基因组序列的进化分析表明,2株病毒为PCV2e基因亚型;对2株病毒与5个不同基因亚型的15株病毒的ORF2氨基酸序列进行比较,结果显示,XJ-SW1、XJ-SW2在ORF2的氨基端与PCV2d同源性较高,在羧基端与PCV2e同源性较高。表明,在新疆沙湾猪场流行的PCV2毒株为PCV2e,该毒株的ORF2存在一定变异。

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