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白菜中BrpR8长非编码RNA表达特性

文献类型: 中文期刊

作者: 岑曦 1 ; 李丹丹 1 ; 刘自广 1 ; 刘春晓 1 ; 杨贺 1 ; 黄小庆 1 ; 李爽 1 ; 汤川泰 1 ; 吴娟 1 ;

作者机构: 1.东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室生命科学学院东北林业大学;黑龙江省农业科学院;名古屋市立大学

关键词: 长非编码RNA;白菜;种子萌发;环境应激应答

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2019 年 10 期

页码: 4641-4646

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了研究白菜中BrpR8长非编码RNA的表达特性,本研究运用生物信息学、整体原位杂交及Northern blotting等方法,对BrpR8 lncRNA进行序列及二级结构特征、表达特性及应激应答特性分析。结果表明:BrpR8 lncRNA长度约261 nt,是白菜中发现的拟南芥AtR8 lncRNA (259 nt)的同源物,它具有RNA聚合酶Ⅲ转录物结构特征,在种子萌发阶段根伸长区特异表达,并响应CuCl2和SA应激环境。结果表明,BrpR8 lncRNA的发现扩大了长非编码RNA已有的物种,为非编码RNA的研究提供了数据参考。

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