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广东水稻核心种质耐冷萌发全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 丁杰荣 1 ; 孙炳蕊 1 ; 于航 1 ; 江立群 1 ; 张静 1 ; 吕树伟 1 ; 陈文丰 1 ; 范芝兰 1 ; 潘大建 1 ; 李晨 1 ; 刘清 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院水稻研究所/广东省水稻育种新技术重点实验室/广东省水稻工程实验室

关键词： 水稻;低温萌发;果糖-1,6-二磷酸醛羧酶;全基因组关联分析

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2022 年 23 卷 005 期

页码： 1425-1437

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 萌发期耐冷性的强弱直接影响水稻直播时的成苗率.为高效地培育萌发期耐冷性强的水稻品种,本研究通过统计309份广东省水稻核心种质资源的低温萌发比率,筛选到57份萌发期耐冷性强的水稻品种.同时,以低温萌发比率为表型数据和高密度的SNP标记为基因型数据,利用全基因组关联分析鉴定到11个水稻低温萌发QTLs.其中qLTG2-1、qLTG7-1、qLTG7-2和qLTG10-1与前人定位的水稻低温萌发QTL共定位.qLTG11-1是本研究新鉴定的最显著的水稻低温萌发QTL.利用RNA-seq和qRT-PCR对其进行候选基因预测和验证,发现在低温萌发期间,qLTG11-1 区间内的LOC_Os11g07020在低温萌发比率高和低的品种中有不同的表达模式.LOC_Os11g07020编码果糖-1,6-二磷酸醛羧酶同工酶,可能通过调控糖酵解反应而影响水稻萌发期耐冷性.本研究筛选到多份耐冷性强的水稻品种,并找到可能调控水稻萌发期耐冷性的候选基因,可为培育萌发期耐冷性强的水稻品种提供参考.

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