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桃SSR-PCR主要因子对扩增产物的影响

文献类型： 中文期刊

作者： 沈志军 1 ; 马瑞娟 1 ; 俞明亮 1 ; 许建兰 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院园艺研究所

关键词： 桃;简单序列重复;PCR扩增;扩增产物

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2006 年 22 卷 01 期

页码： 80-84

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以寿星桃为试材,通过Mg2+和DNA聚合酶、模板DNA和引物用量的两个双因素试验,以及dNTP用量的单因素试验,研究了5个主要因子对SSR扩增结果的影响,并对桃SSR反应体系进行了优化。结果表明,Mg2+和DNA聚合酶的用量对SSR扩增结果起着关键作用,且两者之间存在明显的互作效应;dNTP用量也对SSR的扩增结果起着重要作用,当浓度在200~300μmol/L时效果较好;模板DNA与引物用量之间没有很明显的互作效应,适当增加引物用量可以提高SSR的正确扩增;优化的桃SSR反应体系为:25μl的总反应体积中含1×PCR Buffe、Mg2+3 mmol/L、DNA聚合酶1.5 U、SSR引物各0.4μmol/L、模板DNA 50 ng、dNTP 200μmol/L。

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