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3株鸭肝炎病毒Ⅰ型结构基因VP1的克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 甘一迪 1 ; 刘家森 1 ; 姜骞 1 ; 郭东春 1 ; 司昌德 1 ; 孟庆文 1 ; 韩凌霞 1 ; 刘娣 2 ; 曲连东 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院

2.黑龙江省农业科学院

关键词: 鸭肝炎病毒(DHV);VP1基因;序列分析

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2009 年 40 卷 06 期

页码: 952-957

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过RT-PCR方法扩增鸭肝炎病毒DHV-1:161/79/V、YH、HN株的VP1基因的核苷酸序列。系统发育分析表明,3株病毒与已发表的DHV-1结构基因VP1核苷酸和氨基酸的同源性分别为92.7%~96.9%和95.4%~96.6%,与DHV-1变异株核苷酸和氨基酸序列的相似性均分别低于75%和88%,表明3株病毒属于DHV-1,与变异株是不同的血清型。强毒DHV-1:161/79/V的VP1蛋白第49和第183位氨基酸为T和H,弱毒DHV-1:YH、HN为S和Q,推测这2处位点的改变可能与病毒的强弱有关;DHV-1和其变异株的VP1蛋白均没有保守的RGD序列;变异株N-DHV:90D、04G在第50和51位比DHV-1多2个氨基酸(Q和D),在第147和185位各缺失1个氨基酸(E和L),而在变异株DHV:AP-03337、AP-04009、AP-04114、AP-04203的第145和146位比DHV-1多了2个氨基酸(G、G);不同血清型的鸭肝炎病毒在46-64位、95-149位、180-223位抗原指数差别较大,推测这些位点的改变可能影响病毒的生物学特性。

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