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棉花HKT基因家族的全基因组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郭琪 1 ; 徐珍珍 1 ; 黄芳 1 ; 徐鹏 1 ; 张香桂 1 ; 沈新莲 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花和油菜重点实验室;南通大学生命科学院

关键词： HKT基因家族;生物信息;棉花

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2017 年 33 卷 05 期

页码： 975-981

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： HKT(high-affinity K+transporter)转运蛋白在调节植物体内K+/Na+转运,参与逆境胁迫调控中发挥重要作用。本研究利用生物信息学方法,系统分析了棉花HKT基因家族的分类、系统进化树、组织表达以及HKT蛋白的亚细胞定位、跨膜结构、基序情况等。结果显示,棉花中共有8个HKT基因家族成员,编码的8个HKT蛋白都定位到了质膜上,具有7~10个不等的跨膜数;系统进化树分析结果表明,棉花8个HKT基因家族成员大致分为2个小组,在进化树上分支比较近的HKT基因家族成员编码的HKT蛋白具有完全相同或者比较类似的motif类型和跨膜数;组织表达分析发现,克劳茨基棉仅有Gr HKT1;1和Gr HKT1;2 2个成员在200 mmol/L的Na Cl溶液处理0 h、3 h、12 h、72 h和144 h后具有不同程度的响应。

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