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油棕Aux/IAA基因家族鉴定与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨蒙迪 1 ; 金龙飞 2 ; 周丽霞 2 ; 窦雅静 1 ; 曹红星 2 ; 李新国 3 ;

作者机构: 1.海南大学热带作物学院

2.中国热带农业科学院椰子研究所海南省热带油料作物生物学重点实验室

3.海南大学园艺学院

关键词: 油棕;Aux/IAA基因家族;生物信息学

期刊名称: 分子植物育种

ISSN:

年卷期: 2021 年 005 期

页码: 1451-1465

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: Aux/IAA基因家族是植物激素生长素(Auxin)早期反应的三大家族之一,研究Aux/IAA基因家族有利于深入探讨生长素信号转导分子机制,而油棕Aux/IAA基因家族的全基因组分析尚无报道。本研究利用生物信息学方法在油棕中鉴定到55个Aux/IAA家族基因,染色体定位分析表明其中50个分布在油棕的除第5、第13、第14、第15染色体外的不同染色体上;聚类分析将油棕Aux/IAA分为A、B两大类群,8个亚族;分析油棕Aux/IAA基因的表达模式,表明其Aux/IAA基因家族不同亚族基因的表达模式存在较大差异,其中一些基因可能与油棕的授粉受精过程相关。本研究将为油棕Aux/IAA基因家族各基因的具体功能研究提供一定的理论依据,并对油棕育种研究和高产栽培提供一定的参考。

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