文献类型： 中文期刊

作者： 陈亮 ¹ ; 汪登强 ² ; 何勇凤 ² ; 吴兴兵 ² ; 朱永久 ² ; 朱挺兵 ² ; 王亚龙 ² ; 杨德国 ³ ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院长江水产研究所/农业部淡水生物多样性保护重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院

2.;中国水产科学研究院长江水产研究所/农业部淡水生物多样性保护重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院

3.;中国水产科学研究院长江水产研究所/农业部淡水生物多样性保护重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院;

关键词： 长鳍吻鮈;微卫星;多重PCR;亲子鉴定

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2017 年 09 期

页码： 1526-1537

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 微卫星多重PCR技术在生物的亲子鉴定、群体遗传分析以及家系管理等方面均得到了广泛的应用。长鳍吻鮈(Rhinogobio ventralis)是我国长江上游特有珍稀鱼类,目前已达3级急切保护状,被列为低危鱼类。为了提高长鳍吻鮈微卫星分型效率,本研究从已开发的微卫星中筛选出15个多态性较高的微卫星位点进行组合扩增,并对位点组合的引物浓度、退火温度和反应体系等条件进行优化,建立了5组各含3个微卫星位点多重PCR体系。利用5组微卫星多重PCR,通过ABI 3730测序仪和Cervus v.3.0软件对136尾长鳍吻鮈进行个体基因型检测以及遗传多样性分析,结果显示,群体的平均等位基因数(number of allele,Na)为15.600,平均期望杂合度(expected heterozygosity,He)为0.825,平均观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)为0.813,平均多态信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.801。对40尾候选亲本和96尾子代进行亲子鉴定分析,结果显示,第一亲本的累积排除概率(combined exclusion probability of the first parent,CE-1P)、第二亲本累积排除概率(combined exclusion probability of the second parent,CE-2P)和双亲累积排除概率(combined exclusion probability of a parent pair,CE-PP)分别为0.999986 07、0.999 999 97和1.000 000 00。使用该5组微卫星多重PCR体系进行亲子鉴定准确率为100%。长鳍吻鮈微卫星多重PCR技术的建立为亲子鉴定、分析群体遗传多样性和辅助家系管理提供了一种高效的技术手段。