文献类型： 中文期刊

作者： 彭强 ¹ ; 叶生鑫 ² ; 黄龙 ² ; 张大双 ² ; 刘颖 ² ; 吴健强 ² ; 张玉珊 ² ; 朱速松 ² ;

作者机构： 1.贵州省水稻研究所

2.贵州省水稻研究所;贵州师范大学生命科学学院;北京百迈客生物科技有限公司;贵州省生物技术研究所

关键词： 水稻;遗传图谱;特定位点扩增片段;作图群体

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 14 卷 08 期

页码： 2127-2132

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对精细定位某一特定性状位点来说,高密度遗传图谱是一个非常实用的工具。本研究以水稻品种V20B/CPSLO17组合衍生的150份重组自交家系作为作图群体,利用特定位点扩增长度测序(SLAF-seq)技术,一种基于下一代测序技术进行大规模开发SNP和基因型分析的高通量新策略,开发SLAF标签和构建水稻高密度遗传图谱。我们共检测到67 017个高质量的SLAF标签,其中多态性SLAF有15 853个,符合构建高质量遗传图谱使用要求的多态性SLAF标签有8 657个。最终成功构建了一个包含12个连锁群,8 602个上图标记,总图距为2 508.65 c M,标记间平均距离为0.29 c M的高密度遗传图谱,该图谱可用于重要农艺性状QTL定位。