文献类型： 中文期刊

作者： 王勋功 ¹ ; 李迎 ² ; 甄毓 ² ; 米铁柱 ² ; 贺惠 ² ; 张玉 ³ ;

作者机构： 1.海洋环境与生态教育部重点实验室;中国海洋大学环境科学与工程学院;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室;中国海洋大学海洋生命学院

2.;海洋环境与生态教育部重点实验室;中国海洋大学环境科学与工程学院;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室;中国海洋大学海洋生命学院

3.;海洋环境与生态教育部重点实验室;中国海洋大学环境科学与工程学院;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室;中国海洋大学海洋生命学院;

关键词： 16S rRNA;454焦磷酸测序;Illumina测序;微生物群落

期刊名称： 海洋环境科学

ISSN： 1007-6336

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 766-772+791

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 作为第二代测序技术的主要平台,454和Illumina测序方法在微生物核酸分析方面有着广泛应用。本研究以16S rRNA基因为标靶,分别采用454和Illumina测序技术对长江口邻近海域表层沉积物中的微生物DNA进行分析,通过对序列长度、微生物群落多样性及组成进行比较,分析两种方法在沉积物微生物群落结构研究方面的适用性。结果表明,Illumina测序获得的序列数和OTU数要多于454,其中获得的OTUs中以非优势菌群为主。Illumina与454相比能够检出更多微生物菌群,且检测到的稀有菌群占有较大比例。综上可知,Illumina测序技术在分析微生物群落多样性及物种组成方面要优于454测序技术,454的长序列优势并未能体现出来,且454测序技术可能低估了微生物组成及其多样性。