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东方田鼠部分BAC文库的微卫星筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 汤敏 1 ; 倪丽菊 2 ; 高骏 3 ; 肖君华 1 ; 胡建华 2 ; 高诚 2 ;

作者机构： 1.东华大学

2.上海市实验动物质量监督检验站

3.上海市农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 东方田鼠;BAC文库;微卫星;菌落杂交;链霉亲和素磁珠

期刊名称： 中国实验动物学报

ISSN： 1005-4847

年卷期： 2012 年 20 卷 03 期

页码： 50-55

收录情况： CSCD

摘要： 目的从东方田鼠的部分BAC文库中筛选微卫星。方法应用非放射性的菌落杂交方法和磁珠富集法从东方田鼠的BAC文库中筛选高质量的微卫星标记。结果以地高辛标记的寡聚核苷酸(CA)20为探针,通过菌落杂交法从136个东方田鼠BAC克隆中筛选出杂交信号最强的20个阳性克隆。再将这20个阳性克隆分别通过链霉亲和素磁珠法构建亚克隆文库,从中选取400个经PCR鉴定为阳性的亚克隆进一步测序分析,共得到220个微卫星序列,阳性率55%。选取重复次数高,侧翼序列完整的微卫星序列设计74对引物,共有35对引物能扩增出清晰的条带,其中16对引物具有多态性。结论成功且高效地从阳性BAC克隆中筛选出微卫星序列,这些微卫星和阳性BAC克隆可用于后续的定位研究。

  • 相关文献

[1]用LA-PCR方法克隆东方田鼠部分Y染色体序列. 姜宪环,蔡慧强,高骏,倪丽菊,李凯,肖君华,周宇荀. 2012

[2]中国6个地区东方田鼠线粒体全基因组的比较与多态性位点的发掘. 高骏,倪丽菊,孙凤萍,肖君华,周宇荀,李凯. 2017

[3]基于微卫星位点的中国4个野生东方田鼠群体的遗传多样性分析. 高骏,倪丽菊,孙凤萍,肖君华,周宇荀,李凯. 2016

[4]微卫星(TATG)_n基序在香菇菌种中的验证. 秦莲花,张红,陈明杰,谭琦,潘迎捷. 2004

[5]长江三角洲白山羊保种群体的SSR遗传多样性分析. 李丹阳,孙玲伟,吴彩凤,张树山,张德福,戴建军. 2021

[6]观赏樱属植物基因组SSR分子标记开发及鉴定. 李水根,关媛,李秀芬,朱继军,李记开,朱建军. 2022

[7]小型猪微卫星标记的遗传多样性. 涂尾龙,张莺莺,黄济,刁玉段,周杰珂,谈永松,王洪洋. 2024

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