您好,欢迎访问新疆农垦科学院 机构知识库!

基于GWAS和WGCNA分析挖掘玉米花期相关候选基因

文献类型: 中文期刊

作者: 钱甫 1 ; 张占琴 2 ; 陈树宾 2 ; 丁永福 2 ; 桑志勤 2 ; 李卫华 1 ;

作者机构: 1.石河子大学农学院/绿洲生态农业兵团重点实验室

2.新疆农垦科学院

关键词: 玉米;花期性状;GWAS;WGCNA;候选基因

期刊名称: 作物学报

ISSN:

年卷期: 2023 年 012 期

页码: 3261-3276

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 花期是玉米重要性状之一,解析玉米花期的遗传基础,挖掘玉米花期关键基因,对于选育广适玉米品种具有重要意义。在580份玉米自交系构成的自然群体中, 3年种植测定散粉期、吐丝期和散粉吐丝间隔期等3个花期性状,利用分布全基因组的31,826个SNPs(single nucleotide polymorphisms)标记进行全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS),结合自交系B73的14个不同发育阶段的转录组数据进行权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA),挑选与玉米开花相关的组织特异性模块和关键基因。GWAS在多环境(2个环境以上)下共定位标记14个,挖掘到潜在候选基因10个, WGCNA挖掘到花期潜在候选基因17个, 2种方法共同挖掘到候选基因3个。Zm00001d052180编码一个MADS-box转录因子19,Zm00001d016814编码NAC转录因子133, Zm00001d048082编码MADS-box转录因子8,这些基因主要参与调节花序生长发育。研究结果为解析玉米花期遗传基础及分子机制提供参考。

  • 相关文献

[1]棉籽油性状全基因组关联分析研究进展. 刘文豪,余渝,吴珂,刘丽,李航,孔宪辉. 2024

[2]Identification of favorable SNP alleles and candidate genes for traits related to early maturity via GWAS in upland cotton. Junji Su,Chaoyou Pang,Hengling Wei,Libei Li,Bing Liang,Caixiang Wang,Meizhen Song,Hantao Wang,Shuqi Zhao,Xiaoyun Jia,Guangzhi Mao,Long Huang,Dandan Geng,Chengshe Wang,Shuli Fan. 2016

[3]陆地棉吐絮率的限制性两阶段多位点全基因组关联分析及候选基因预测. 谢晓宇,王凯鸿,秦晓晓,王彩香,史春辉,宁新柱,杨永林,秦江鸿,李朝周,马麒,宿俊吉. 2022

[4]绵羊BMPR-IB基因作为多胎性能的候选基因在肉用多胎品种选育中的应用研究. 钟发刚,王新华,李辉,刘守仁,杨永林,甘尚权,王建华,张永胜,何其宏,魏荣安. 2005

[5]阿勒泰羊臀脂沉积性状4个候选基因的表达及分析. 王耀武,甘尚权,刘守仁,狄冉,胡文萍,王翔宇,贺小云,刘秋月,储明星. 2016

[6]陆地棉纤维长度和强度的优异位点挖掘及其候选基因预测. 史春辉,张爱,马麒,谢晓宇,刘娟娟,李美丽,李朝周,王彩香,宿俊吉. 2021

[7]影响奶牛产奶性状候选基因的研究进展. 王文君,欧阳克蕙,沈敏,徐明生,上官新晨,陈琴. 2008

[8]棉花产量构成因素性状的全基因组关联分析. 王娟,马晓梅,周小凤,王新,田琴,李成奇,董承光. 2022

[9]滴头压力对玉米生长及产量的影响的效果初探. 梁飞,曾胜和,宋凤斌,王国栋,郭斌,陈云. 2015

[10]北疆膜下滴灌玉米氮磷配施效应研究. Liang Fei,梁飞. 2012

[11]新疆玉米吨粮田的开发与建设. 田拴才. 1992

[12]种植方式对玉米养分吸收动态和利用效率的影响. 肖春华,李少昆,刘景德,王文静,宋秋生. 2005

[13]近年我国玉米超高产田的分布、产量构成及关键技术. 高聚林,赵明,董树亭,李少昆,杨祁峰,刘永红,王立春,薛吉全,柳京国,李潮海,王永宏,王友德,宋慧欣,赵久然. 2012

[14]种植方式对玉米干物质积累、养分吸收动态变化的研究. 肖春华,李少昆,刘景德,王文静,宋秋生. 2004

[15]不同种植方式下玉米干物质积累、养分吸收动态特点的研究. 肖春华,李少昆,刘景德,王文静,宋秋生. 2004

[16]套种玉米宽窄行的光合特性与果穗性状研究. 肖华,刘景德,王文静,任林昌,徐红军. 2002

[17]烯效唑和胺鲜酯在玉米上的调控效果及机理研究. 雷骥良,赵丽娟,曹新文,祝建波,闫洁,郭斌. 2017

[18]灌溉量对膜下滴灌玉米生长和产量的影响. 李全胜,王国栋,郭斌,梁飞. 2019

[19]增施微生物肥对膜下滴灌玉米根区土壤微生物、酶活性的影响. 李全胜,王国栋,谢宗铭,刘政,梁飞. 2019

[20]滴施不同水溶肥对玉米产量形成的影响. 梁飞,王国栋,王克全,尤琦英,郭斌,张磊,曾胜和. 2018

作者其他论文 更多>>