文献类型： 中文期刊
作者： 柳淑芳 1 ; 李献儒 2 ; 杨钰 3 ; 杨善军 4 ; 庄志猛 5 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所
2.青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
3.大连海洋大学水产与生命学院
4.国家海洋局第三海洋研究所
5.青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室
关键词： 鲉形目;鲉科;DNA条形码;DNA条形码芯片
期刊名称： 中国水产科学
ISSN： 1005-8737
年卷期： 2016 年 23 卷 05 期
页码： 1006-1022
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为建立鲉形目内各物种的快速鉴别方法,本研究扩增了我国47个鲉形目物种并下载了Gen Bank上收录的鲉形目共计23科85属233种873条细胞色素C氧化酶I基因(COI)序列,分析该基因结构特性。结果表明,鲉形目DNA条形码基因的碱基变异中,不变位点508个,占总位点数的82.1%;转换位点70个,颠换位点41个,分别占总位点数的11.3%和6.6%;种内遗传距离为0~0.019,平均遗传距离为0.003?0.0034;属内种间遗传距离为0.003~0.258,平均值为0.086?0.038;基于233个物种的COI序列构建的系统进化树显示,227个物种(97.4%)能聚为独立分支,且具有较高支持度。在此基础上以鲉科11属39种鱼类的DNA条形码为例,筛选出25个种的37个特异性探针,以此探针对鲉科鱼类进行物种快速鉴定成功率为64.1%,研究结果表明DNA条形码芯片用于鲉科的鉴定具有一定的可行性。
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