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猪星状病毒的流行病学调查及遗传进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李本强 1 ; 陶洁 1 ; 程靖华 1 ; 石迎 1 ; 乔长涛 1 ; 刘惠莉 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室  

关键词: 猪星状病毒;混合感染;季节性;遗传进化分析;基因序列重组

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2021 年 010 期

页码: 1046-1050,1073

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解上海地区猪群中猪星状病毒(PAstV)的流行现状及其遗传特性,本研究于2016年~2020年间在上海不同地区10个猪场共采集了1 416份仔猪腹泻粪便样品,利用RT-PCR方法及生物信息学技术进行检测与分析。结果显示,PAstV的总阳性率为26.2%,PAstV与其他腹泻病病原的混合感染情况较复杂,二重感染率占比达56.93%,主要以PAstV/猪嵴病毒(PKoV)为主(20.07%);三重感染率占比29.41%,以PAstV/PKoV/猪流行性腹泻病毒(PEDV)(10.09%)感染模式为主;四重感染率为11.4%,以PAstV/牛病毒性腹泻病毒(BVDV)/猪札幌病毒(PoSaV)/猪萨佩罗病毒(PSV)(13.51%)感染为主。猪群中PAstV的流行与气温差有很大关系,在季节交替时节流行率较高,特别是秋冬交替时节。选取其中2个PAstV阳性样品(JS-PAstV和CM-PAstV)进行全基因组序列的测定和分析,结果显示两者的全基因组同源性不高,仅为73.8%。全基因组进化分析显示,CM-PAstV分别与挪威、日本、美国的PAstV 3型的亲缘性较近;而JS-PAstV与匈牙利的PAstV 3型的亲缘性最近。对ORF2基因进行病毒重组分析,显示JS-PAstV和CM-PAstV的ORF2基因均与人星状病毒之间存在重组现象。提示,上海地区猪群中存在PAstV 3型的流行,且遗传距离较远,但存在与人星状病毒重组的风险,需进一步监测关注。本研究数据丰富了国内PAstV的流行病学资料,可为该病的风险防控提供科学数据。

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[2]猪圆环病毒2型和3型混合感染与遗传进化分析. 孙莹慧,夏叶,陈鹏飞,缪德年. 2023

[3]上海郊区猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查. 周佳明,陈冈,司伏生,于瑞嵩,陈冰清,谢春芳,李震,董世娟. 2022

[4]PEDV流行株的分离鉴定及其遗传进化分析. 陶洁,熊年年,张春玲,李本强,孟丽. 2016

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