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陆地棉CC-NBS-LRR基因的克隆及特征分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张保龙 1 ; 杨郁文 1 ; 倪万潮 1 ; 佘建明 1 ; 沈新莲 1 ; 何晓兰 1 ; 张香桂 1 ; 徐英俊 1 ; 姚姝 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院农业生物遗传生理研究所

关键词： 陆地棉;CC-NBS-LRR基因;GHNBS;基因表达

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2006 年 22 卷 04 期

页码： 351-355

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据抗病基因核苷酸结合位点(Nuc leotide b ind ing site,NBS)设计简并性引物,从陆地棉cDNA中进行RT-PCR扩增。获得含NBS保守域的EST,进一步用RACE技术和TAIL PCR技术获得其中1个EST的全长基因序列,并获得GHNBS基因的5′调控序列。此基因被命名为GHNBS。该基因的编码区长2 583 bp,编码861个氨基酸,GHNBS编码的氨基酸序列与拟南芥R基因具有28%的同源性。GHNBS与拟南芥的其他几个NBS-LRR基因比较发现,它们在保守区外的相似性相当低。Southern杂交和网上数据库搜索分析都表明GHNBS是1个寡拷贝基因。通过半定量RT-PCR分析发现GHNBS在棉花的蕾、花瓣、韧皮部、根及叶中均有表达且在根、叶中表达量比其它部位强,在木质部基本不表达。

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