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奥利亚罗非鱼EF-1α基因的克隆与结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 唐永凯 1 ; 李建林 1 ; 李红霞 1 ; 陈雪峰 2 ; 俞菊华 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

2.南京农业大学

关键词: 奥利亚罗非鱼;克隆;EF-1α

期刊名称: 动物学杂志

ISSN: 0250-3263

年卷期: 2008 年 43 卷 05 期

页码: 9-14

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 真核生物延伸生长因子基因(EF-1α)在蛋白质翻译过程中起着重要的作用,其序列具有高度的保守性,是一种管家基因。本文通过RT-PCR克隆出奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)EF-1α的部分cDNA序列,其长度为425bp,翻译成141个氨基酸,计算的蛋白质分子量为15.1ku。同源性分析显示,奥利亚罗非鱼EF-1α氨基酸序列与尼罗罗非鱼(O.niloticus)的相似性最高,为100%;与青(鱼将)(Oryzias latipes)、欧洲鲈(Dicentrarchus labrax)、斑马鱼(Danio rerio)、鲑鱼(Salmo trutta)的相似性分别为92%、91%、85%、82%;与小鼠(Mus musculus)、大鼠(Rattus norvegicus)、人(Homo sapiens)、鸡(Gallus gallus)的相似性均为85%。同时克隆出奥利亚罗非鱼EF-1α相应的DNA序列,共506bp。cDNA与DNA的序列比对显示克隆出的奥利亚罗非鱼EF-1α含有1个内含子,这为将来设计EF-1α荧光定量引物以及测定其在不同组织中的表达量变化打下基础。

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