您好,欢迎访问广东省农业科学院 机构知识库!

丝瓜(Luffa cylindrica)EST-SSR分子标记的验证及多态性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 骆彩霞 1 ; 罗剑宁 2 ; 赵钢军 2 ; 何晓莉 2 ; 周玲艳 1 ; 吴海滨 2 ;

作者机构: 1.仲恺农业工程学院

2.广东省农业科学院蔬菜研究所

关键词: 丝瓜(Luffa cylindrica);EST-SSR;分子标记;多态性

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2020 年 019 期

页码: 6410-6417

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 丝瓜中的特异性分子标记较少,严重阻碍了丝瓜分子标记辅助育种的进程.为解决这一问题,本研究在广东省农业科学院蔬菜研究所开发的8 523对EST-SSR标记的基础上进一步挑选出406对,在有棱丝瓜自交系S304 (Luffa acutangula (Linn.) Roxb.)、普通丝瓜P93075 (Luffa cylindrica (Linn.) Roem.)及二者杂交后代F1中进行了验证和多态性分析.结果表明,在406对EST-SSR标记中,352对在S304、P93075及二者杂交后代F1中有扩增产物,占合成标记的86.70%;其中297对标记具有多态性,占可扩增标记的84.38%;在297对具有多态性的标记中,除了二碱基重复序列中重复次数为9及三碱基重复序列中重复次数为7的标记外,标记的多态性随着重复次数的增加而增强,且重复次数到一定值时标记的多态性处于相对稳定状态.本研究发现的关于标记多态性与重复次数之间关系的规律将为EST-SSR标记的高效筛选提供参考价值;筛选并验证的标记丰富了丝瓜EST-SSR标记的数量,为下一步丝瓜种质资源遗传多样性分析、品种鉴定及分子标记辅助育种等相关研究提供数据基础.

  • 相关文献

[1]De Novo Characterization of Leaf Transcriptome Using 454 Sequencing and Development of EST-SSR Markers in Tea (Camellia sinensis). Wu, Hualing,Chen, Dong,Li, Jiaxian,Qiao, Xiaoyan,Huang, Hualin,He, Yumei,Wu, Hualing,Chen, Dong,Li, Jiaxian,Qiao, Xiaoyan,Huang, Hualin,He, Yumei,Yu, Bo.

[2]Core EST-SSR Marker Selection Based on Genetic Linkage Map Construction and Their Application in Genetic Diversity Analysis of Litchi (Litchi chinensis Sonn.) Germplasm Resources. Xiang, X.,Chen, D. M.,Ma, S. P.,Ma, W. C.,Fan, J.,Yang, X. Y.,Liu, M.,Sun, Q. M.. 2014

[3]肇实转录组测序及生物信息学分析 被引量:1. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019

[4]肇实转录组测序及生物信息学分析. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019

[5]张溪香芋转录组测序及生物信息学分析. 王继华,罗群胜,梅瑜,杨少海. 2020

[6]利用SNP和EST-SSR分子标记鉴定荔枝新种质御金球. 孙清明,李永忠,向旭,陈道明,杨晓燕,方静,吴绪波,周东辉,马帅鹏,马文朝. 2013

[7]基于EST-SSR标记的甘薯种质资源DNA指纹图谱构建. 罗忠霞,房伯平,李茹,王章英,黄立飞,陈景益,张雄坚,李育军,陈新亮,黄实辉. 2014

[8]利用EST-SSR分子标记鉴别荔枝新品种红灯笼. 向旭,欧良喜,白丽军,赵俊生,孙清明,陈洁珍,蔡长河. 2010

[9]甘薯EST资源的SSR信息分析. 黄立飞,房伯平,陈景益,张雄坚,罗忠霞. 2009

[10]广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析. 周炎花,乔小燕,马春雷,乔婷婷,金基强,姚明哲,陈亮. 2011

[11]广东仁化白毛茶优异株系遗传多样性的EST-SSR分析. 乔小燕,吴华玲,陈栋,李家贤,黄华林,晏嫦妤,何玉媚. 2010

[12]EST-SSR标记在蔬菜作物中的开发和应用进展. 吴海滨,罗少波,罗剑宁,龚浩,何晓莉. 2012

[13]中国96个荔枝种质资源的EST-SSR遗传多样性分析. 向旭,欧良喜,陈厚彬,孙清明,陈洁珍,蔡长河,白丽军,赵俊生. 2010

[14]荔枝两个F_1杂交群体的EST-SSR鉴定及多样性分析. 孙清明,马帅鹏,马文朝,赵俊生,方静,杨晓燕,向旭. 2014

[15]柑桔线虫抗性主基因座Tyr1的特异标记开发与遗传作图改进(英文). 向旭,邓占鳌,郑启发,陈存贤,Frederick G.Gmitter Jr. 2009

[16]清远黄羽乌鸡mtDNA多态性及与9种具有药用价值乌鸡品种的亲缘关系研究. 何国戈,李莹,郑经成,王艳,葛影影,何静怡,胡克科,宋佳,罗成龙. 2019

[17]华南地区桑园和荒地两种生境中红火蚁觅食工蚁的食物组成. 张波,何余容,陈婷,齐国君,吕利华. 2015

[18]一个家蚕微孢子虫新基因的序列分析及蛋白质在酿酒酵母细胞中的定位. 罗洁,邓远洪,黄为,李田,杨琼,殷梅,潘国庆,李春峰,周泽扬. 2013

[19]石斛SSR标记的开发及可转移性分析. 邱道寿,郑希龙,蔡时可,郑锦荣,罗焕明,张蕾,邓瑞云,李武,刘晓津. 2013

[20]广东不同时期水稻主栽品种抗病基因同源序列多态性分析. 唐志明,陈建酉,陆永法,周华成,莫雪娇,毛兴学,李晓方. 2013

作者其他论文 更多>>