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紫色甘薯渝紫薯7号黄烷酮3-羟化酶基因的克隆和序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄元射 1 ; 舒田 2 ; 毛景欣 3 ; 陈敏 3 ;

作者机构： 1.安顺学院农学院

2.贵州省农业科技信息研究所

3.西南大学药学院

关键词： 渝紫薯7号;黄烷酮3-羟化酶;基因克隆;序列分析

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2016 年 29 卷 03 期

页码： 486-490

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为渝紫薯7号品种后续的遗传转化及其分子育种提供理论基础,采用同源克隆和RACE方法对其生物合成途径中关键酶基因进行同源性克隆及生物信息学分析。结果表明:从渝紫薯7号中克隆到F3H基因的全长c DNA序列(Genbank登录号为KU144881),序列全长为1280 bp,包括5’端UTR+一个编码368个氨基酸残基的编码区+3’端UTR+poly A尾巴;F3H基因蛋白具有结合酮戊二酸的RXS基序Arg287-Ser285和结合亚铁离子的保守氨基酸His219、Aps221和His277,结构域位于蛋白的核心(Fe2+被包埋在酶的中心);在Gen Bank中,渝紫薯7号F3H的序列与圆叶牵牛的F3H序列之间具有很高的相似性,为96%;渝紫薯7号F3H蛋白与近缘物种茑萝氨基酸相似性较高,为94%;渝紫薯7号F3H符合植物中普遍存在的F3H基因,同时具有生物学活性。

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