文献类型： 中文期刊

作者： 郑乾明 ¹ ; 柏自琴 ¹ ; 王小柯 ¹ ; 林乾 ¹ ; 王彬 ¹ ; 马玉华 ¹ ;

作者机构： 1.贵州省果树科学研究所

关键词： 仙人掌X病毒;宏转录组测序;遗传变异;序列一致性

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2022 年 50 卷 004 期

页码： 1-7

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]分析侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒(Cactus virus X,CVX)及其NTU株系的基因组序列遗传变异,为建立分子检测和防控体系奠定理论基础.[方法]对感染病毒的样品采用宏转录组测序和生物信息学分析,分离病毒基因组序列并分析分子变异和系统进化.[结果]获得4条CVX(CVX-LW、CVX-RF、CVX-ZNS 和 CVX-ZYP)和5条 CVX-NTU(CVX-NTU-LW、CVX-NTU-RF、CVX-NTU-ZNF、CVX-NTU-ZNS和CVX-NTU-ZYP)贵州火龙果分离物近全长基因组序列,长度为6 494~6 603 bp,覆盖参考基因组96.2%~99.6%;CVX贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.3%~98.6%,与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.1%~98.0%;CVX-NTU贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.1%~98.8%,与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.6%~99.1%;CVX和CVX-NTU群体未出现明显的遗传分化.[结论]研究获得的CVX和CVX-NTU贵州火龙果分离物近全长基因组序列表现较高的一致性,未发生明显遗传变异.