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谷子蔗糖合成酶基因家族鉴定及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王凌云 1 ; 郭明 2 ; 赵艳 2 ; 瓮巧云 2 ; 马海莲 2 ; 宋晋辉 2 ; 袁进成 2 ; 董志平 2 ; 刘颖慧 3 ;

作者机构: 1.河北北方学院;河北省沽源县农牧局;河北省农林科学院谷子研究所

2.;河北北方学院;河北省沽源县农牧局;河北省农林科学院谷子研究所

3.;河北北方学院;河北省沽源县农牧局;河北省农林科学院谷子研究所;

关键词: 谷子;蔗糖合成酶;SiSuS基因;生物信息学分析;蛋白结构

期刊名称: 江苏农业科学

ISSN: 1002-1302

年卷期: 2017 年 15 期

页码: 30-34

收录情况: 北大核心

摘要: 蔗糖合成酶(sucrose synthase,SuS)是蔗糖代谢的关键酶,在植物的代谢反应中起重要作用。以谷子基因组数据库为平台,借用生物信息学手段对谷子SiSuS基因家族进行挖掘和分析。结果表明,谷子的SiSuS基因家族包括9个基因,它们不均匀地分布在5条染色体上。该家族氨基酸序列长度为809~1 088 aa,外显子数目为10~16个,大多数蛋白质为弱酸性。谷子SiSuS的氨基酸序列具有9个保守基序;进化树分析结果表明,谷子、水稻、高粱SiSuS蛋白聚在一起。

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