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玉米矮花叶病毒分离物基因组克隆及多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张虎 1 ; 景晓雅 1 ; 孙柳清 1 ; 崔爱民 1 ; 张鹏华 1 ; 单皓 1 ; 陈伟 1 ;

作者机构: 1.山西省农业科学院小麦研究所

关键词: 玉米;SCMV;基因组;多样性

期刊名称: 中国农业科技导报

ISSN: 1008-0864

年卷期: 2019 年 009 期

页码: 36-43

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 玉米是重要的粮食和经济作物,在国民经济中占有重要地位.玉米矮花叶病毒(Sugercan mosaic virus,SCMV)广泛分布在世界各玉米主产区,严重威胁玉米的安全生产.系统研究SCMV的发生危害、遗传结构与进化机制,对病毒病的防治具有重要意义.从山西省4个玉米主产区采集122个玉米叶片样品(2015年62份,2016年60份).经RT-PCR检测证实36个样品(2015年20个样品,2016年16个样品)为SCMV阳性,且广泛分布于山西省玉米各个产区.从这些阳性样品中分离、测序、克隆得到了一个新的SCMV分离物,该分离物(包括5'-UTR和3'-UTR端)基因组全长9 539 bp,编码3 063个氨基酸.该分离物与26个SCMV分离物(NCBI)进行一致率、系统发育分析表明SCMV存在较大遗传变异,27个分离物被划分为3个与地理位置无明显相关性的不同进化群体.选择压力分析表明,负向选择可能是SCMV遗传变异的原因之一.对变异位点统计分析发现,该结果将为评估SCMV在中国的流行病学特征奠定基础,有助于SCMV的长期可持续防控策略的制定.

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